Stagione influenzale 2015-16. Dati di sorveglianza virologica

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Sorveglianza virologica settimana 46
Durante la settimana 46/2015 sono stati raccolti 101 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet. Nessuno ? risultato positivo al virus influenzale.
Nella Tabella 2 sono elencati i laboratori che hanno comunicato, in questa settimana, i dati relativi alle indagini di laboratorio.
Nel periodo precedente all?inizio della sorveglianza virologica sono stati segnalati casi sporadici di influenza in Italia, per lo pi? associati a soggetti di ritorno dall?estero o in stretto contatto con loro. Si tratta di 3 ceppi di tipo A e 2 di tipo B, tutti da pazienti non vaccinati, in particolare:
2 virus A(H3N2) identificati in due pazienti di 91 e 80 anni, ricoverate presso il Policlinico S. Orsola-Malpighi di Bologna.
1 virus A(H1N1)pdm09 e 1 di tipo B identificati, presso l?Universit? di Trieste, in due pazienti ospedalizzati rispettivamente di 37 e 50 anni, entrambi di ritorno da un viaggio in Medio Oriente.
1 virus di tipo B identificato, presso l?IRCCS ?L. Spallanzani? di Roma, in un paziente di 46 anni non ricoverato.
http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_18_11_15.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 47
Durante la settimana 47/2015 sono stati raccolti 111 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet. Nessuno ? risultato positivo al virus influenzale.
Nella Tabella 1 sono elencati i laboratori che hanno comunicato, in questa settimana, i dati relativi alle indagini di laboratorio.
Nella tabella 2 vengono riassunti i dati virologici ottenuti finora (sett. 41-47/2015).
A(H1N1)pdm09
L?analisi filogenetica relativa al ceppo A(H1N1)pdm09, recentemente isolato in Friuli Venezia Giulia, non evidenzia cambiamenti significativi rispetto ai virus italiani della passata stagione, confermandone l'appartenenza al sottogruppo genetico 6B. Rispetto al ceppo vaccinale A/California/7/2009, il suddetto virus presenta una ulteriore sostituzione aminoacidica in HA1, S84N, riscontrata anche in altri ceppi recentemente circolanti nel mondo.
A(H3N2)
Le analisi di caratterizzazione molecolare finora eseguite su una porzione del gene HA del primo ceppo H3N2 identificato a Bologna (vedi Rapporto n.1 del 18/11/2015), ne hanno evidenziato la stretta correlazione con virus di riferimento appartenenti al sottogruppo genetico 3C.2a, all?interno del quale si collocano la maggior parte dei ceppi H3 recentemente circolanti nel mondo.

https://l.facebook.com/l.php?u=http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_25_11_15.pdf&h=0AQFo6yDh

 

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Sorveglianza virologica: aggiornamento n. 48
Durante la settimana 48/2015 sono stati raccolti 114 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet. Tra questi uno, segnalato dall?Universit? di Trieste, ? risultato positivo al virus influenzale di tipo A(H3N2).
http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_2_12_15.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n.49

Durante la settimana 49/2015 sono stati raccolti 146 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet. Tra questi uno, segnalato dall?Universit? di Genova, ? risultato positivo al virus influenzale di tipo A(H3N2).

http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_9_12_15.pdf

 

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Soveglianza virologica : settimana n.50

Durante la settimana 50/2015 sono stati raccolti 150 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet e, di questi, 3 sono risultati positivi al virus influenzale, 2 di tipo A e 1 di tipo B. I 2 virus A, di cui 1 ? risultato appartenere al sottotipo H3N2 e l?altro ? in corso di sottotipizzazione, sono stati segnalati rispettivamente dal Policlinico di Bari e dall?Universit? di Parma. Il virus di tipo B ? stato isolato presso l?Universit? di Milano.
http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_16_12_15.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 51
Durante la settimana 51/2015 sono stati raccolti 166 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet e, di questi, 6 sono risultati positivi al virus influenzale, 5 di tipo A e 1 di tipo B. Tra i 5 virus A, 1 ? risultato appartenere al sottotipo H3N2 ed ? stato segnalato dall?Universit? di Palermo, mentre l?Universit? di Parma ha segnalato 4 virus di sottotipo H1N1pdm09. Il virus di tipo B ? stato segnalato dall?IRCCS San Matteo di Pavia.
Caratterizzazione molecolare ed analisi filogenetica - Virus A(H1N1)pdm09
Le analisi di caratterizzazione molecolare effettuate sulla porzione HA1 del gene HA dei primi 3 virus A(H1N1)pdm09 segnalati in Italia ne hanno evidenziato l?appartenenza al sottogruppo genetico 6B, a cui afferisce la maggior parte dei ceppi recentemente circolanti nel mondo e di quelli isolati in Italia nella passata stagione. Tuttavia, il ceppo A/FVG/104/2015 presenta alcune sostituzioni aminoacidiche in HA1 (S84N, S162N, I216T), rispetto al ceppo vaccinale A/California/7/2009, tipiche di un nuovo sub-cluster recentemente emerso anche in altre parti del mondo. I ceppi di Parma sono caratterizzati, invece, dalle seguenti mutazioni in HA1: A48P, S69P.
http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_23_12_15.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n.52
Durante la settimana 52/2015 sono stati raccolti 116 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet e, di questi, 5 sono risultati positivi al virus influenzale di tipo A. In particolare, 1 ? risultato appartenere al sottotipo H3N2, segnalato dall?AS di Bolzano, mentre l?Universit? di Parma e il Policlinico di Bari hanno segnalato 4 virus di sottotipo H1N1pdm09.
http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_30_12_15.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n 1

Durante la settimana 53/2015 sono stati raccolti 123 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet e, di questi, 8 sono risultati positivi al virus influenzale di tipo A. In particolare, 3 sono risultati appartenere al sottotipo H3N2, segnalati dalle Universit? di Padova e Palermo, 4 virus di sottotipo H1N1pdm09 segnalati dall?Universit? di Parma e Palermo e dall?azienda ospedaliera Amedeo di Savoia di Torino dall?IRCCS, 1 A non ancora sottotipizzato ? stato segnalato dall?IRCCS San Matteo di Pavia.

http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_7_1_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 2

Durante la settimana 2/2016 sono stati raccolti 255 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet e, di questi, 29 sono risultati positivi al virus influenzale, 18 di tipo A e 11 di tipo B. Nell?ambito del tipo A, 4 virus sono risultati di sottotipo H3N2, segnalati dall?Universit? di Padova e dall?AS di Bolzano e 9 di sottotipo H1N1pdm09, segnalati dalle Universit? di Firenze, Padova, Palermo, Parma, Trieste, dal Policlinico di Bari e dall?AO ?Amedeo di Savoia? di Torino; i restanti 5 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.
I ceppi B sono stati segnalati dalle Universit? di Milano, Palermo, Trieste e dall?AO ?Amedeo di Savoia? di Torino. Di questi, 3 sono stati caratterizzati come appartenenti al lineaggio B/Victoria ed 1 al lineaggio B/Yamagata.

http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_20_1_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n.3

In evidenza:
 In questa settimana si riporta nel mondo un ulteriore incremento nella circolazione dei virus influenzali, in particolare di A(H1N1)pdm09. Nell?ambito dei ceppi di tipo B, continuano le segnalazioni di virus appartenenti al lineaggio Victoria.
 Nel presente report viene inoltre incluso un aggiornamento sui risultati delle analisi filogenetiche condotte sulle emagglutinine (HA) di alcuni virus influenzali A(H3N2)

Durante la settimana 3/2016 sono stati raccolti 307 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 50 sono risultati positivi al virus influenzale (25 di tipo A e 25 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 7 virus sono risultati di sottotipo H3N2, segnalati dalle Universit? di Padova e Palermo e dall?AO ?Amedeo di Savoia? di Torino e 16 di sottotipo H1N1pdm09, segnalati dalle Universit? di Firenze, Padova, Palermo, Parma, Perugia, dall?AO ?Amedeo di Savoia? di Torino, dall?AO dei Colli Monaldi-Cotugno di Napoli e dall?AS di Bolzano; i restanti 2 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.
I ceppi B sono stati segnalati dalle Universit? di Genova, Milano, Padova, Palermo, Parma, Trieste, dall?AO ?Amedeo di Savoia? di Torino, dall?IRCCS San Matteo di Pavia e dall?AO Ospedali riuniti di Ancona. Di questi, solo 13 sono stati caratterizzati e sono risultati appartenenti al lineaggio B/Victoria.

Analisi filogenetica dei virus influenzali A(H3N2) attualmente circolanti in Italia
L?analisi filogenetica relativa al gene HA dei primi virus influenzali A(H3N2) isolati in Italia nella presente stagione (Figura 2) ha confermato la stretta correlazione con virus di riferimento appartenenti al sottogruppo genetico 3C.2a, a cui afferisce la maggior parte dei ceppi H3N2 recentemente circolanti nel mondo. I virus appartenenti a questo sottogruppo, come noto, presentano caratteristiche molecolari associate ad una ridotta capacit? emagglutinante e, di conseguenza, ad un?aumentata difficolt? nella identificazione e caratterizzazione antigenica. Alcuni dei virus H3N2 identificati pi? di recente in Italia si raggruppano insieme al ceppo di riferimento A/Hong Kong/7127/2014.

http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_27_1_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 4




Durante la settimana 4/2016 sono stati raccolti 463 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 139 (30%) sono risultati positivi al virus influenzale (61 di tipo A e 78 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 28 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 18 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 15 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati. Tra i ceppi B, 33 sono stati caratterizzati e, di questi, 29 sono risultati appartenere al lineaggio B/Victoria e 4 al lineaggio B/Yamagata.
Pertanto, a differenza di quanto riportato nella maggior parte dei paesi europei e nel mondo, si registra una co-circolazione di ceppi di sottotipo H1N1pdm09 e H3N2 nell?ambito del tipo A e, secondo i dati dell?ultima settimana, una sostenuta circolazione anche dei virus di tipo B.



http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_3_2_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 5





In evidenza:

In questo report viene incluso un aggiornamento sui risultati dell?analisi filogenetica condotta sulle emagglutinine di alcuni virus influenzali A(H1N1)pdm09 circolanti in Italia, rappresentativi della stagione in corso (Figura 2), per i quali si osserva un certo grado di evoluzione genetica.



Durante la settimana 5/2016 sono stati raccolti 530 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 176 (33%) sono risultati positivi al virus influenzale (81 di tipo A e 95 di tipo B). Anche in questa settimana si registra, pertanto, una maggior proporzione di virus influenzali di tipo B (54%) rispetto ai ceppi di tipo A (46%), nell?ambito delle identificazioni virali.

Per quanto riguarda i ceppi di tipo A, 43 virus sono risultati di sottotipo H3N2 e 28 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 10 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 16 sono stati caratterizzati e sono risultati appartenenti al lineaggio B/Victoria.



Caratterizzazione molecolare ed analisi filogenetica - Virus A(H1N1)pdm09

L?analisi filogenetica relativa al gene HA di ceppi A(H1N1)pdm09 isolati in Italia nei primi mesi della stagione in corso confermano l?appartenenza di tali virus al sottogruppo genetico 6B (Figura 2), a cui afferisce la maggior parte dei ceppi recentemente circolanti nel mondo. Nell?ambito di tale sottogruppo, ? stato recentemente identificato un nuovo sub-cluster (evidenziato da un riquadro rosso in figura), caratterizzato dalle sostituzioni aminoacidiche S84N, S162N (che introduce un potenziale sito di glicosilazione) e I216T in HA1, in cui confluiscono anche alcuni ceppi isolati in Italia ed, in particolare, A/FVG/104/2015, A/Parma/294/2015 e A/Parma/295/2015.

Altri ceppi isolati a Parma sempre nello stesso periodo sono, invece, caratterizzati dalle seguenti mutazioni in HA1: A48P, S69P.

Nonostante l?evoluzione genetica mostrata dai recenti ceppi A(H1N1)pdm09 isolati nel mondo, analisi antigeniche eseguite presso i Centri di riferimento OMS dimostrano che la maggior parte dei virus inclusi nel suddetto nuovo sub-cluster, rimane correlata al ceppo vaccinale A/California/7/2009 (http://www.who.int/influenza/publications/riskassessment_AH1N1pdm09_201602/en/).






http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_10_2_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 6

Durante la settimana 6/2016 sono stati raccolti 638 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 227 (36%) sono risultati positivi al virus influenzale (112 di tipo A e 115 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 67 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 34 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 11 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.
Nell?ambito dei virus di tipo B, 36 sono stati caratterizzati e, tra questi, 35 (97%) sono risultati appartenenti al lineaggio B/Victoria e solo 1 al lineaggio B/Yamagata.


http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_17_2_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 7






In evidenza:

 Come precedentemente riportato, anche in questa settimana viene segnalato un maggior numero di identificazioni relative ai virus influenzali A(H3N2) ed ai virus di tipo B.

 Nel presente report viene incluso un aggiornamento sui risultati delle analisi filogenetiche condotte sulle emagglutinine (HA) dei virus influenzali A(H3N2) attualmente circolanti in Italia (Figura 2).



Durante la settimana 7/2016 sono stati raccolti 577 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 202 (35%) sono risultati positivi al virus influenzale (89 di tipo A e 113 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 63 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 16 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 10 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 51 sono stati caratterizzati e, tra questi, 50 (98%) sono risultati appartenenti al lineaggio B/Victoria e 1 al lineaggio B/Yamagata.



Caratterizzazione molecolare ed analisi filogenetica - Virus A(H3N2)



L?analisi filogenetica relativa al gene HA di ceppi A(H3N2) isolati in Italia, in questa prima fase della stagione in corso (da ottobre 2015 ad inizio febbraio 2016), confermano l?appartenenza di tali virus al sottogruppo genetico 3C.2a, caratterizzato dalle sostituzioni amino acidiche N144S, F159Y, K160T, N225D e Q311H, gi? comparso nella precedente stagione influenzale.

Nell?ambito del raggruppamento 3C.2a, sono stati identificati ulteriori sottogruppi. Uno di questi ? caratterizzato dalle sostituzioni amino acidiche R142K e Q197R, mentre l?altro presenta le sostituzioni N171K, I406V e G484E (Figura 2).






http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_24_2_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 8





Durante la settimana 8/2016 sono stati raccolti 629 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 267 (42%) sono risultati positivi al virus influenzale (111 di tipo A e 156 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 74 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 32 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 5 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 64 sono stati caratterizzati e, tra questi, 63 (98%) sono risultati appartenenti al lineaggio B/Victoria e 1 al lineaggio B/Yamagata.





http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_2_3_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 9



Durante la settimana 9/2016 sono stati raccolti 544 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 213 (39%) sono risultati positivi al virus influenzale (94 di tipo A e 119 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 46 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 30 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 18 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati. Tra i ceppi B, 18 sono stati caratterizzati e sono risultati tutti appartenenti al lineaggio B/Victoria.



http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_9_3_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n.10





Sulla base dei dati raccolti in quest?ultima settimana, sembra che il picco stagionale della circolazione dei virus influenzali sia stato ormai raggiunto.

 Nel complesso, ad oggi in Italia, si registra una lieve prevalenza nella circolazione dei virus influenzali di tipo B (56%) rispetto ai virus A e, nell?ambito dei virus di tipo A sottotipizzati, i ceppi H3N2 risultano leggermente dominanti (63%) rispetto agli H1N1pdm09.

 In questo report viene incluso un aggiornamento sui risultati delle analisi evolutive condotte sul dominio HA1 del gene dell?emagglutinina (HA) di alcuni virus influenzali di tipo B, rappresentativi della stagione in corso .



Durante la settimana 10/2016 sono stati raccolti 519 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 159 (31%) sono risultati positivi al virus influenzale (71 di tipo A e 88 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 48 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 10 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 13 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 44 sono stati caratterizzati, di cui 42 appartenenti al lineaggio B/Victoria e 2 al lineaggio B/Yamagata.





http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_16_3_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 11



Durante la settimana 11/2016 sono stati raccolti 396 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 145 (37%) sono risultati positivi al virus influenzale (67 di tipo A e 78 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 40 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 20 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 7 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 27 sono stati caratterizzati, di cui 26 appartenenti al lineaggio B/Victoria e 1 al lineaggio B/Yamagata.



http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_23_3_16.pdf

 

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Sorveglianza virologica: settimana n. 13





Durante la settimana 13/2016 sono stati raccolti 252 campioni clinici dai diversi laboratori afferenti alla rete Influnet, di cui 80 (32%) sono risultati positivi al virus influenzale (29 di tipo A e 51 di tipo B). Nell?ambito del tipo A, 14 virus sono risultati di sottotipo H3N2, e 11 di sottotipo H1N1pdm09; i restanti 4 virus A segnalati non sono stati ancora sottotipizzati.

Tra i ceppi B, 16 sono stati caratterizzati di cui 14 appartenenti al lineaggio B/Victoria e 2 al lineaggio B/Yamagata.





Analisi della farmaco-suscettibilit? di virus influenzali circolanti nella stagione 2015/2016



Il NIC-ISS, da diversi anni, oltre a svolgere le attivit? di caratterizzazione antigenica e molecolare dei virus influenzali, finalizzate all?identificazione delle nuove varianti da inserire nel vaccino, conduce attivit? di monitoraggio per la valutazione della suscettibilit? degli isolati stagionali ai farmaci antivirali, con particolare riferimento agli inibitori della neuraminidasi (IN- oseltamivir e zanamivir). Tale attivit? viene svolta mediante saggio enzimatico dell?inibizione della neuraminidasi (MUNANA) e analisi di sequenza della neuraminidasi (NA). I risultati ottenuti vengono trasmessi regolarmente all?OMS ed all?ECDC.

Viene qui di seguito riportata una sintesi di tali studi.

ITALIA

Dall?inizio della stagione influenzale 2015/2016, tra i virus pervenuti al NIC-ISS, un totale di 38 ceppi isolati in Italia (16 H1N1pdm2009, 16 H3N2 e 6 B) sono stati saggiati per la suscettibilit? agli inibitori della neuraminidasi. Le analisi fenotipiche e di sequenza condotte su tali isolati hanno permesso di evidenziarne la totale sensibilit? nei confronti sia dello zanamivir sia dell?oseltamivir.

Il saggio fenotipico ha, infatti, mostrato valori di IC50 (concentrazione di farmaco inibente il 50% dell?attivit? della NA virale) tipici dei virus influenzali sensibili ad entrambi gli IN. Inoltre, le analisi genotipiche non hanno evidenziato la presenza di marcatori molecolari noti per essere associati a resistenza a tali farmaci.

EUROPA

A partire dalla settimana 40/2015 ad oggi, un totale 2.292 virus influenzali (1.992 A/H1N1pdm09, 95 A/H3N2 e 205 B) sono stati saggiati per la suscettibilit? agli inibitori della neuraminidasi. In particolare, in 12 ceppi virali A/H1N1pdm09 ? stata identificata la mutazione NA-H274Y notoriamente associata alla resistenza nei confronti dell?oseltamivir. Soltanto in un isolato A/H3N2 ? stata identificata la mutazione NA-E119V correlata ad una ridotta suscettibilit? all?oseltamivir.

Per ulteriori approfondimenti relativi al quadro europeo, si rimanda al report dell?ECDC della settimana 12/2016.





http://www.iss.it/binary/fluv/cont/Agg.Vir_6_4_16.pdf