Re: Brazil finds new strain of H1N1 virus - NOT
Just found this, buried in yesterday news... modified at 7pm it sounds to me that the "new strain stuff" was a reporter stuff, not from the researcher... anyways... here it goes...
***WARNING GOOGLE TRANSLATION ***
Tuesday, June 16, 2009, 13:17 | Online
Adolfo Lutz isolated variant of the H1N1 virus that arrived in Brazil
The sequencing will contribute to the production of influenza vaccine and evaluation of response to antiviral
Alexandre Gon?alves, O Estado de S. Paulo
Adolfo Lutz isolated variant of the H1N1 virus that arrived in Brazil
S?O PAULO - The Institute Adolfo Lutz performed the complete sequence for the first time in Brazil, two key genes of the virus A (H1N1). The first patient diagnosed with swine flu in S?o Paulo provided the samples of the micro-organism.
When compared with the first sequence performed in California, the scientists identified small changes. However, the rate of similarity between the viruses decoded in Brazil and the United States is still more than 99.5%. Researchers find good news is that the virus has changed so little.
The announcement was made yesterday in the auditorium of the Institute of Infectious Diseases Emilio Ribas, Sao Paulo. The hospital has received, on April 24, the traveler of 26 years who brought the virus from Mexico now sequenced by scientists. "We still do not know what are the impacts of these variations in the action of the virus," says Cec?lia Luiza Sim?es dos Santos, biologist of the Adolfo Lutz.
The researchers chose to sequence two genes: the MP gene - which encodes the matrix protein M1 and M2, more abundant in the composition of the virus - and the HA gene - which produces the hemagglutinin protein, responsible for the invasion of the host cell.
Mutations occurred in the HA gene. "Fortunately, not identified in any known active site of the protein," Cec?lia exception. The antibodies that the body produces to fight the virus acts on the active site of the molecule. Therefore, any significant change in this region of the protein can render vaccines ineffective. "The vaccines in development will work," notes the scientist.
The M gene sequence is identical to the virus Californian. As its American parent, contains a label that indicates resistance to a class of antivirals called amantadine.
"The next step is to sequence the gene encoding neuranimidase" provides Cecilia. The substance is responsible for releasing the virus after infection of cells to undertake new contagion. Oseltamivir phosphate - considered one of the main weapons against the new influenza - acting on neuranimidase and therefore a mutation in this protein can decrease the effectiveness of the remedy. The flu virus has eight genes.
Scientists compared the sequenced strain of the virus in S?o Paulo the dozens of already registered in the database of the National Center for Biotechnology Information (NCBI, U.S.), USA. "There was much similarity with strains from Italy, Texas, China and Korea," says Cecilia. "None was identical, but it was only a preliminary analysis."
A month ago, researchers from the Instituto Oswaldo Cruz (IOC-Fiocruz) had deposited in the NCBI database of partial sequences of the M gene obtained from three different patients: two in Rio de Janeiro and one in Minas Gerais. About 80% of M1 and M2 proteins were decoded at the time.
"In September, a meeting at the World Health Organization (WHO) to analyze the strains sequenced in the southern hemisphere," says the virology of the Adolfo Lutz, Terezinha Maria de Paiva. "Based on the data, we identified the need to develop a vaccine other than the northern hemisphere, for example."
(Extended with more information to 19h53)
Source:
http://www.estadao.com.br/noticias/...asileira-do-virus-da-gripe-suina,388181,0.htm
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Original:
ter?a-feira, 16 de junho de 2009, 13:17 | Online
Adolfo Lutz isola variante do v?rus H1N1 que chegou ao Brasil
O sequenciamento vai contribuir para a produ??o da vacina contra a gripe e avalia??o da resposta aos antivirais
Alexandre Gon?alves, de O Estado de S. Paulo
Adolfo Lutz isola variante do v?rus H1N1 que chegou ao Brasil
S?O PAULO - O Instituto Adolfo Lutz realizou o sequenciamento completo, pela primeira vez no Pa?s, de dois genes importantes do v?rus A(H1N1). O primeiro paciente diagnosticado com a gripe su?na em S?o Paulo forneceu as amostras do micro-organismo. Ao comparar com os primeiros sequenciamentos realizados na Calif?rnia, os cientistas identificaram pequenas muta??es. Contudo, a taxa de similaridade entre os v?rus decodificados no Brasil e nos Estados Unidos ainda ? superior a 99,5%. Pesquisadores consideram uma boa not?cia que o v?rus tenha se modificado t?o pouco.
O an?ncio foi feito ontem no audit?rio do Instituto de Infectologia Em?lio Ribas, em S?o Paulo. O hospital recebeu, no dia 24 de abril, o viajante de 26 anos que trazia do M?xico o v?rus agora sequenciado pelos cientistas. ?Ainda n?o sabemos quais s?o os impactos dessas varia??es na a??o do v?rus?, afirma Cec?lia Luiza Sim?es dos Santos, bi?loga do Adolfo Lutz.
Os pesquisadores escolheram dois genes para sequenciar: o gene MP - que codifica as prote?nas da matriz M1 e M2, mais abundantes na composi??o do v?rus - e o gene HA - que produz a prote?na hemaglutinina, respons?vel pela invas?o da c?lula hospedeira.
As muta??es ocorreram no gene HA. ?Felizmente, n?o identificamos nenhuma no chamado s?tio ativo da prote?na?, ressalva Cec?lia. Os anticorpos que o corpo humano produz para combater o v?rus agem sobre o s?tio ativo da mol?cula. Por isso, qualquer muta??o significativa nessa regi?o da prote?na pode tornar vacinas ineficazes. ?As vacinas em fase de desenvolvimento dever?o funcionar?, aponta a cientista.
O gene M sequenciado ? id?ntico ao do v?rus californiano. Como seu parente americano, cont?m um marcador que indica resist?ncia a uma classe de antivirais chamada amantadina.
?O pr?ximo passo ? sequenciar o gene que codifica a neuranimidase?, prev? Cec?lia. A subst?ncia ? respons?vel por libertar os v?rus das c?lulas depois da infec??o para que realizem novos cont?gios. O fosfato de oseltamivir - considerado uma das principais armas contra a nova gripe - age sobre a neuranimidase e, por isso, uma muta??o nesta prote?na pode diminuir a efic?cia do rem?dio. O v?rus da gripe possui oito genes.
Os cientistas compararam a estirpe do v?rus sequenciado em S?o Paulo a algumas dezenas das j? cadastradas na base de dados do Centro Nacional de Informa??o Biotecnol?gica (NCBI, em ingl?s), nos Estados Unidos. ?Havia muita semelhan?a com estirpes da It?lia, Texas, China e Coreia?, afirma Cec?lia. ?Nenhuma era id?ntica, mas foi apenas uma an?lise preliminar.?
H? um m?s, pesquisadores do Instituto Oswaldo Cruz (IOC-Fiocruz) j? tinham depositado no banco de dados do NCBI sequenciamentos parciais do gene M obtidos de tr?s pacientes diferentes: dois no Rio de Janeiro e um em Minas Gerais. Cerca de 80% das prote?nas M1 e M2 foram decodificadas na ocasi?o.
?Em setembro, haver? uma reuni?o na Organiza??o Mundial da Sa?de (OMS) para analisar as estirpes sequenciadas no hemisf?rio sul?, afirma a virologista do Adolfo Lutz, Terezinha Maria de Paiva. ?Com base nos dados, podemos identificar a necessidade de desenvolver uma vacina diferente do hemisf?rio norte, por exemplo.?
(Ampliada com mais informa??es ?s 19h53)
Fonte:
http://www.estadao.com.br/noticias/...asileira-do-virus-da-gripe-suina,388181,0.htm
