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?tude: une nouvelle souche du virus H5N1 en Egypte peut ?tre li?e ? l'augmentation des cas humains

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  • ?tude: une nouvelle souche du virus H5N1 en Egypte peut ?tre li?e ? l'augmentation des cas humains

    Cr?dit: Shiloh

    Traduction Google

    ?tude: une nouvelle souche H5N1 en Egypte peut ?tre li?e ? l'augmentation des cas humains

    Robert Roos | Nouvelles ?diteur | CIDRAP Nouvelles | 3 avril 2015

    Une nouvelle souche du virus de la grippe aviaire H5N1 qui a apparemment gagn? pr?dominance en Egypte ces derniers mois pourrait ?tre associ? ? la forte augmentation des cas humains de H5N1 l? pendant ce m?me laps de temps, une ?quipe internationale de scientifiques a rapport? hier dans Eurosurveillance.

    Les chercheurs ont d?clar? que la nouvelle souche s'est largement r?pandu dans la volaille de l'Egypte et que deux r?cents H5N1 isolats de patients humains tombent dans le m?me groupe. Il est trop t?t pour dire si la souche a acquis une plus grande capacit? de sauter des oiseaux aux humains, ils ont ?crit, et d'autres ?tudes sont n?cessaires pour savoir si cela est le cas.

    ? ce stade, il ne peut ?tre "exclu avec certitude que le phylotype ?mergent de virus peut avoir augment? le potentiel zoonotique et peut ?tre transmis de fa?on plus efficace aux humains, bien que cette hypoth?se ne peut ?tre tir?e de la preuve mol?culaire d?crit ici," indique le rapport. Les auteurs sont d'Egypte, d'Allemagne et de l'Organisation pour l'alimentation et l'agriculture des Nations Unies.

    435 foyers en cinq mois
    La forte augmentation des cas humains et foyers de grippe aviaire en Egypte depuis plusieurs mois a suscit? des sp?culations quant ? savoir si des mutations dans le virus sont mieux ?quiper ? se r?pandre dans la volaille et de la volaille ? l'homme. Le rapport indique que 435 foyers de grippe aviaire ont ?t? signal?s par les autorit?s v?t?rinaires ?gyptiennes d'Octobre 2014 ? F?vrier 2015.

    Les cas humains de H5N1 ont eu lieu d'abord en Egypte en 2006, et un total de 204 cas confirm?s ont ?t? signal?s de 2006 ? 2014, avec un taux de 35,8% de l?talit?, disent les chercheurs. Cette ann?e, le total de cas a atteint 116 en date du 21 mars, avec 36 d?c?s, soit plus de la moiti? du nombre pour les neuf ann?es pr?c?dentes, ajoutent-ils.


    Pour l'?tude, l'?quipe a s?lectionn? un ?chantillon de 29 isolats H5N1 repr?sentant diff?rentes esp?ces de volailles, de lieux, et d'op?rations (exploitations commerciales, les troupeaux de basse-cour, et les march?s d'oiseaux vivants). Ils ont g?n?r? des donn?es de s?quence pour les segments d'h?magglutinine (HA) de tous les 29 virus et des g?nes de la neuraminidase (NA) de 15 isolats. En plus, ils ont s?quenc? la totalit? du g?nome de quatre des isolats.

    Gr?ce ? une analyse phylog?n?tique pour voir o? les virus s'adaptent sur l'arbre de la famille H5N1, l'?quipe a conclu qu'elles appartiennent ? un groupe distinct au sein du clade d?fini pr?c?demment, 2.2.1.2. Ils ont en outre constat? qu'aucun des anciens virus de ce clade ont ?t? d?tect?s en Egypte depuis octobre dernier, indiquant que la nouvelle souche est devenue pr?dominante.

    Les donn?es de s?quence pour les g?nes internes des virus sont en accord avec les conclusions pour les s?quences HA et NA ", indiquant que les nouveaux virus repr?sentent un groupe distinct qui proviennent de virus circulant pr?c?demment de clade 2.2.1.2," indique le rapport.

    En outre, l'?quipe a constat? que deux virus H5N1 chez des humains infect?s en novembre dernier "font partie de la m?me groupe d'expansion," avec des propri?t?s similaires de mutation. Les deux sont les seules s?quences de virus accessibles au public provenant de cas humains r?cents en Egypte.

    Mutations HA
    Une analyse de la s?quence HA a r?v?l? une modification amino-acide, K373R, qui semble ?tre caract?ristique de la souche ?mergente, vu que rarement dans le pass?. Trois autres mutations dans la souche sont associ?s ? une liaison accrue au type humain r?cepteurs du virus de la grippe, mais ces mutations avaient ?t? vus dans le pr?c?dent clade 2.2.1 virus en Egypte, indique l'article.

    "Depuis aucun substituant de mutations ont ?t? trouv?es dans ?pitopes HA, nous ne pr?voyons pas de diff?rences marqu?es dans les propri?t?s antig?niques de la phylotype ?mergents par rapport ? la circulation du clade pr?c?demment," indique le rapport. Il ajoute que ce est en partie confirm?e par le test comment les virus de la nouvelle souche et d'autres virus H5 ont r?agi avec des anticorps des oiseaux qui avaient ?t? expos?s ? diverses souches H5.

    L'?quipe a ?galement trouv? quatre changements amino-acides dans le g?ne NA de la nouvelle souche. Trois d'entre eux ?taient des sites sur la prot?ine qui induisent B- ou des r?ponses des cellules T du syst?me immunitaire.

    Les auteurs commentent qu'un nouveau cluster H5N1 est apparu en Egypte une fois avant, mais n'est pas devenu pr?dominant. Une souche qui a ?t? d?sign? comme clade 2.2.1.1 a ?merg? ? la fin de 2007 et s'est ?tendu chez la volaille, mais a ensuite disparu jusqu'? la fin de 2010. Elle n'a pas remplac? 2.2.1 virus, et apparemment a caus? un seul cas humain.

    L'?quipe ?crit qu'il est difficile d'?valuer si oui ou non l'augmentation r?cente de foyers de volailles H5N1 en Egypte est attribuable aux propri?t?s biologiques de la nouvelle souche chez les volailles ou non.

    "Dans tous les cas, la hausse r?cente observ?e dans les flamb?es chez les volailles a probablement entra?n? une augmentation des risques d'exposition pour les humains en contact avec des volailles, ce qui peut avoir provoqu? une augmentation de l'incidence des cas humains," ?crivent-ils. Leurs conclusions ne prouvent pas que la nouvelle souche saute aux humains plus facilement, ajoutent-ils, mais la possibilit? ne peut ?tre exclue.
    ...



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    Le rapport de Eurosurveillance (en Anglais)

    Cr?dit Sharon Sanders:

    EMERGENCE OF A NOVEL CLUSTER OF INFLUENZA A(H5N1) VIRUS CLADE 2.2.1.2 WITH PUTATIVE HUMAN HEALTH IMPACT IN EGYPT, 2014/15




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    Le rapport de L'OMS:

    Traduction Google

    Surveillance, pr?vision et action

    Grippe aviaire A (H5N1) en Egypte, mise ? jour le 21 mars 2015

    21 Mars 2015 | Le minist?re de la Sant? et de la population de l'Egypte a notifi? ? l'Organisation mondiale de la Sant? (OMS) une addition de 17 cas humains de grippe aviaire A (H5N1).

    Avec ces nouveaux cas, le nombre total de cas de grippe aviaire A (H5N1) en Egypte s'?l?ve ? 116, dont 36 d?c?s pour la p?riode du 1er Janvier au 17 Mars 2015. Depuis son signalement pour la premi?re fois en mars 2006, un total de 318 cas humains de grippe aviaire A (H5N1), dont 112 d?c?s (taux de l?talit? = 35,2%) ont ?t? rapport?s en Egypte.

    Parmi ces cas humains nouvellement signal?s de grippe aviaire A (H5N1), 11 cas ?taient des femmes et six cas ?taient de sexe masculin. Ces cas humains sont signal?s dans les gouvernorats de Sharkia, Behera, Gizeh, Qaluobia, Menia, Qena, Dakahlia et Kafr Alshekh.

    Du 8 au 12 mars 2015, une mission commune de haut niveau a ?t? men?e en Egypte comprenant des repr?sentants de l'OMS, l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture, l'Organisation mondiale de la sant? animale, US Naval m?dicale Unit?-3 et de l'UNICEF sur la situation courante du H5N1 en Egypte et de comprendre les risques actuels et futurs de la transmission des virus de la grippe aviaire circulant actuellement. La mission a examin? l'efficacit? des mesures de contr?le des maladies r?centes et en cours mises en ?uvre par les secteurs de la sant? humaine et animale, ainsi que les lacunes ?valu?es dans les politiques et strat?gies de lutte contre la maladie.

    Des recommandations ont ?t? pr?sent?es au minist?re de la Sant? et de la population apr?s la conclusion de la mission.

    Tableau 1. Nombre cumul? de cas humains confirm?s en laboratoire de grippe aviaire A (H5N1) signal?s ? l'OMS, 2006-2015
    Year
    Cases
    Deaths
    2006
    18
    10
    2007
    25
    9
    2008
    8
    4
    2009
    39
    4
    2010
    28
    13
    2011
    40
    15
    2012
    11
    5
    2013
    4
    3
    2014
    29
    13
    2015 (17 March)
    116
    36
    Total
    318
    112
    Le nombre total de cas inclut le nombre de d?c?s.

    L'OMS signale les cas confirm?s en laboratoire seulement.


    21 March 2015 | The Ministry of Health and Population of Egypt has notified the World Health Organization (WHO) of an additional 17 human cases of avian influenza A(H5N1).
    "Safety and security don't just happen, they are the result of collective consensus and public investment. We owe our children, the most vulnerable citizens in our society, a life free of violence and fear."
    -Nelson Mandela
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