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G?nome du canard d?cod?: espoir pour la lutte contre la grippe A

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  • G?nome du canard d?cod?: espoir pour la lutte contre la grippe A

    G?nome du canard d?cod?: espoir pour la lutte contre la grippe A



    Le g?nome du canard colvert, ? l'origine de la plupart des canards domestiques, a ?t? d?crypt?. Son analyse pourrait permettre de mieux conna?tre ses m?canismes de d?fense contre les virus de la grippe aviaire, a annonc? dimanche une ?quipe internationale de chercheurs.
    Avec le poulet, le canard constitue une des principales sources de viande, d'oeufs et de plumes pour l'?conomie mondiale. Mais il est aussi le premier r?servoir naturel pour les virus de la grippe aviaire (grippe A).
    La plupart du temps, les souches de grippe A restent relativement inoffensives pour le canard. Mais l'?quilibre tr?s ancien entre le volatile h?te et la grippe aviaire a ?t? rompu au cours des derni?res ann?es avec l'?mergence des virus de type H5N1.
    Epizooties
    Des souches de ce virus ont provoqu? des ?pizooties parmi les oiseaux de plus de 60 pays, avec plus de 600 cas d'infection humaine constat?s ? ce jour et un taux de mortalit? de 59% chez l'homme.
    Plus r?cemment, d'autres virus de grippe aviaire (H9N2, H7N2 et le dernier en date H7N9) ont ?galement infect? des humains, principalement en Asie.
    En s?quen?ant le g?nome du colvert (Anas platyrhynchos), les chercheurs se sont particuli?rement concentr?s sur les g?nes li?s ? l'immunit? pour les comparer avec ceux des trois autres esp?ces d'oiseau dont l'ADN est d?j? connu: le poulet, la dinde et le diamant mandarin, un petit passereau australien.
    G?nes en double exemplaire
    Le r?pertoire g?n?tique immunitaire du canard est globalement "similaire" ? celui du poulet et du diamant mandarin, mais "il comporte aussi des g?nes qui ne sont pas pr?sents dans les trois autres esp?ces", ?crivent les auteurs dans leur ?tude publi?e par la revue britannique "Nature genetics".
    En outre, le canard est dot? de certains de ces g?nes en double exemplaire, contrairement au poulet. Cela pourrait expliquer pourquoi son syst?me immunitaire r?agit mieux que celui d'autres oiseaux face ? la grippe aviaire, sugg?rent les chercheurs.

  • #2
    Re: G?nome du canard d?cod?: espoir pour la lutte contre la grippe A

    Complete Open Access Nature Genomics paper here: http://www.nature.com/ng/journal/vao...s/ng.2657.html

    Comment


    • #3
      Re: G?nome du canard d?cod?: espoir pour la lutte contre la grippe A

      English thread: http://www.flutrackers.com/forum/sho...d.php?t=207324





      .pdf here: http://www.nature.com/ng/journal/vao...df/ng.2657.pdf

      anas platyrhynchos is the mallard. ---10-week-old female Beijing duck ----
      We were wondering whether the Asian domestic ducks were different
      in that they can get viruses that evolved away from the index,
      which we didn't see in North American mallards.
      Well, it could just be because domestic ducks or commercial ducks
      are not popular in North America.

      A BioProject is a collection of biological data related to a single initiative, originating from a single organization or from a consortium. A BioProject record provides users a single place to find links to the diverse data types generated for that project



      ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/genom...mary_Assembly/

      I didn't find the chromosomes in fasta-format yet
      I'm not sure whether and when they will be available.

      Do I understand correctly, that they have influenza-specific genes, which evolved
      since mallards get influenza ? But that's supposed to be only some thousand years ?!?
      While DNA changes are more slowly. When we dig out the bones of a mallard that died
      >10000 years ago, might that show us whether mallards got flu 10000 years ago ?

      phylo of Eurasian ducks:
      Phylogenetic relationships, demographic history, and geographic distribution of the mtDNA haplotypes of the mallard Anas platyrhynchos were examined in three populations, Indian, Northern European, and Far Eastern. Two divergent haplotype groups, A and B, were found in the Far Eastern population, wh …

      Anas zonorhyncha in Asia, "spot billed duck"
      I'm interested in expert panflu damage estimates
      my current links: http://bit.ly/hFI7H ILI-charts: http://bit.ly/CcRgT

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