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HA und NA von H5N2 in Bayern 2007 ver?ffentlicht

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  • HA und NA von H5N2 in Bayern 2007 ver?ffentlicht

    das wurde damals zuerst für H5N1 gehalten, ist aber ein ganz anderes Virus,
    ähnlich zu Viren die schon lange vorher in Europa kursierten:


    Code:
    difference in 1/100 percent
    -----differences
    ----------nucleotides considered
    ---------------number
    --------------------strain
    
    ---------NA--------------------------------------------
       0    0 1410 4852 A/mallard/Bavaria/1/2007(H5N2)
      35    5 1410 4850 A/mallard/Bavaria/1/2005(H5N2)
      56    8 1410 4851 A/teal/Italy/3931-38/2005(H5N2)
     362   51 1408 4827 A/duck/Hokkaido/9/99(H9N2)
     383   54 1408 4829 A/duck/Hokkaido/13/00(H9N2)
     384   46 1197 4828 A/duck/Hokkaido/31/97(H9N2)
     404   57 1409 4848 A/duck/Italy/4609/2003(H7N2)
     411   58 1409 4849 A/quail/Italy/4610/2003(H7N2)
     426   51 1197 4830 A/duck/Hokkaido/26/99(H9N2)
     460   65 1410 4847 A/duck/Eastern China/164/2002(H6N2)
     467   56 1197 4831 A/duck/Hokkaido/9/99(H9N2)
     562   79 1404 4833 A/duck/Jiang Xi/1286/2005(H5N2)
     569   80 1404 4834 A/duck/Jiang Xi/3345/2005(H5N2)
     596   84 1408 4835 A/garganey/SanJiang/160/2006(H5N2)
     602   85 1410 4841 A/gull/Moscow/3100/2006(H6N2)
     607   81 1334 4780 A/mallard/Italy/1980/1993(H5N2)
    
    ---------HA----------------------------------------------
       0    0 1695 2751 A/mallard/Bavaria/1/2007(H5N2)
     194   33 1695  604 A/mallard/Sweden/40/02(H5N6)
     230   39 1695  601 A/mallard/Sweden/31/02(H5N2)
     359   61 1695  607 A/mallard/Sweden/58/02(H5N3)
     412   70 1695 2143 A/mallard/Italy/208/2000(H5N3)
     424   72 1695   14 A/duck/Mongolia/54/2001(H5N2)
     436   74 1695   27 A/duck/Hokkaido/Vac-1/04(H5N1)
     445   75 1684 2131 A/duck/Yunnan/435/2002(H5N3)
     454   76 1671  198 A/duck/Primorie/2621/01(H5N2)
     455   75 1646   22 A/duck/Mongolia/596/01(H5N3)
     457   77 1684 2139 A/mallard/Italy/1980/1993(H5N2)
     477   81 1695  756 A/turkey/Italy/1258/2005(H5N2)

    die NA ist sehr ähnlich zu dem der H5N2-Stockente aus Bayern in 2005,
    aber das HA ist reassoziiert und stammt womöglich aus Schweden.
    I'm interested in expert panflu damage estimates
    my current links: http://bit.ly/hFI7H ILI-charts: http://bit.ly/CcRgT
Working...
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